Bedingt durch die Neutronenstatistik erreicht der FRM II bei 20MW Reaktorleistung eine (ungestörte) maximale thermische Neutronenflußdichte von etwa 8x10¹⁴cm^-2s^-1. Das Maximum der Neutronenverteilung liegt im Moderatortank und daher in einem für Experimente leicht zugänglichen Bereich.

Das Verhältnis von maximaler thermischer Neutronenflußdichte zur Reaktorleistung ist deutlich höher als bei jedem anderen Reaktor weltweit. Das bedeutet, daß beim FRM II die gewünschte hohe thermische Neutronenflußdichte bei extrem geringer Untergrundstrahlung (Gammastrahlung, schnelle Neutronen) bereitgestellt wird, was unter anderem einen großen Vorteil für die experimentelle Nutzung bedeutet.

Damit wird mit dem FRM II auch ein neuer Meilenstein in der Weiterentwicklung von Forschungsreaktoren erreicht.